Проезд вдоль здания Двенадцати коллегий с 1776 года именовался Коллежской линией. Само здание построено в 1722-1741 годах по проекту Доменико Трезини при участии его сына Джузеппе, соорудившего галереюКрытый проход, расположенный по наружному периметру здания, опирающийся на несущие стены, колонны, аркады. со стороны двора, и архитектора Т. Швертфегера, разработавшего отделку верхних этажей. Здание состоит из двенадцати идентичных корпусов, соединенных между собой, в каждом из которых размещалась коллегия – высшее учреждение управления страной. От этого времени сохранился уникальный коридор второго этажа, протянувшийся через все здание. В 1802 году коллегии были преобразованы в министерства и размещены в разных местах города. В 1819 году треть здания занял вновь образованный Петербургский университет, ставший к 1835 году единственным его хозяином. И в 1849 году бывшая Коллежская линия, перед этим иногда включавшаяся в состав Биржевой, становится Университетской.

6 октября 1923 года Университетская линия стала линией имени Профессора Менделеева в честь великого русского ученого Д. И. Менделеева, работавшего в Университете с 1865 по 1890 год. С 1911 года здесь функционирует Музей-архив Д. И. Менделеева. Фактически установилось название без лишних слов – линия Менделеева, а с 1930-х годов – Менделеевская линия.

Дмитрий Иванович Менделеев (1834-1907) более всего известен как создатель периодической системы химических элементов, но его научные интересы были гораздо более разносторонними. Уже в 1865 году он защитил докторскую диссертацию «Рассуждение о соединении спирта с водой», за что заслужил у некоторых шутников репутацию «основоположника научного алкоголизма». В действительности Менделеев всю жизнь занимался природой растворов, получив много выдающихся результатов. Кроме того, он первым начал исследовать критическое состояние вещества, разрабатывал приемы взвешивания, исследовал свойства нефти(франц. nef, от лат. navis – корабль) – вытянутое помещение, часть интерьера (обычно в зданиях типа базилики), ограниченное с одной или с обеих продольных сторон рядом колонн или столбов. и был одним из инициаторов строительства нефтепроводов.

Менделеев был страстным борцом за права ученых и студентов, против бюрократического и полицейского произвола, нажив тем самым множество врагов. Он так и не стал академиком Российской Академии наук, многочисленные обращения его коллег в Нобелевский комитет тоже не возымели результата. В 1890 году в ответ на отказ министра народного просвещения И. Д. Делянова восстановить университетскую автономию Менделеев покинул Университет. Некоторое время он состоял консультантом Научно-технической лаборатории Морского министерства, где организовал производство изобретенного им пироколлодия – нового вида бездымного пороха, а в 1892-м стал Главным хранителем Депо образцовых мер и весов на Забалканском (Московском), 19. Уже через год он превратил Депо в Главную палату мер и весов, которую возглавлял до конца жизни. Сейчас это Научно-исследовательский институт метрологии, носящий его имя. Менделеев активно добивался перехода страны на метрическую систему, но сделано это было только после Октябрьской революции.